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混元子也以清剿异族为己任，不料因为此界的生命普遍比中维度要弱小，所以异族在此界更加横行无阻，它们也变得更加的狡诈，辗转逃到了荒凉的边缘星域之中藏身，伺机捕食人族。
www.biquge001.com混元子一路追击它们到此，但是发现它们的族群已经相当壮大，相继消灭了好几个星体上的人族和其他动物，趁机壮大了族群。他便带领部下设计引诱它们到附近的一处星体，以绝大的法力引爆了那颗星星，重创了异族。但人算不如天算，中间出了岔子，自己也受了重伤，又损失了一些手下。这时他想联络大自在天魔和他的部属，但是此界地处偏远，当初的空间裂缝又基本弥合，再无法联系到中维度宇宙。
无奈之下，他只好带着手下魔族勇士就近在找了一颗星星留在上边养伤，却不料发现了此地已有一些比较原始的人族出现，其中一些还是从中央星域迁徙过来的修士。于是他就收编了一些人，传授他们一些天魔法门，成立了混元宗，准备日后对抗异族。不过人算不如天算，当时这里的一些达到真仙境地的修者，他们既不知道他的意图，又不满意他霸道的行事风格和那种几近残酷的训练方式。很自然的产生了抵触心理，而混元子对于此界的人族也是视为低等民族，也不屑于与之太多的交流。
这样一来其他人把他当成是要在此地称霸的魔头，便联合起来对付他。混元子其人本来就性格孤傲，加上他法力惊人，也不屑于把事情的来龙去脉告诉那些在他眼中是蝼蚁一般的存在。外人也不知道正是因为混元子一直在保护他们，才使他们没有被异族奴役和残杀。不久之后混元子发现异族又准备蠢蠢欲动，而新组建的宗门中新生力量还不足以与之对抗，此时自己的伤势始终未愈，便想抽取一部分此处星体的生命本源之力消灭来犯之敌。没想到他的举动被别人误以为是要毁灭这颗星体，于是这些人在惶恐之下纷纷联合起来，对抗混元魔宗，给他捣乱。这时异族也浑水摸鱼，在暗中挑动局势，误导本地的修士。结果最后混元子腹背受敌，最终中了异族的暗算，他在最后关头牺牲了自己，抽取了星体的一小部分元能，点燃了自己的生命和法力，消灭了很多的异族。但是他和许多来自中维度宇宙的手下也都身死道消了。
那次大战之后异族元气大伤，这时本地的那些修道者也意识到了异族的危险和混元宗真正的用意。于是再也没有人和混元宗冲突了，转而合力攻击异族。之后的几任混元宗宗主吸取了教训，联合了其他势力，再接再厉把他们打的又一次龟缩起来。因为常年大战异族，混元宗和本地修士也都是元气大伤，开始收缩势力进入蛰伏的状态。同样的异族也是损失巨大，因此沉寂了很长时间，双方进入了一段比较平和的时期。直到第六代混元宗主时又再次来袭。可惜的是，第六代宗主向无前，是一个极为厉害的角色。
他早年没有担任宗主时，在游历星海的时候曾遇到一处有奇特修士的世界。他斩落了那星体的一角，并搬运回来。将它变成了这颗星体上的第四个大陆，他命名其为天星洲，并与天星洲的修士立约，以天星洲作为对抗异族的主战场，他把混元宗的力量都集中在了天星洲上。天星洲上的各个家族和宗派在混元宗的率领下对抗异族，混元宗在天星洲上建立了多个据点，扼守整个大陆。在向宗主的带领下，异族在本地的残余势力扫除一空，混元宗也开始将天星洲作为自己的本部道场。又经过了几代之后，混元宗始终变得更加兴盛，但是门中的各个分支也开始产生了分歧，除了直属宗主的三大部之外，其他的堂口支脉开始了内部的明争暗斗。到了第九代宗主——灭世金灯东方云起的时代，玄天帝君率领着一群神州族的真仙流落到了此地，在东天部洲建立了天庭。很快也和混元宗也起了冲突，双方大打出手，结果处于低潮的混元宗吃了点小亏。最后双方达成了一致，天庭不染指天星洲，但是混元宗也允许了天庭的龙王——四海君，掌控包括天星洲海域在内的东海。后来四海君还特意把自己的宫殿——水晶宫就设置在了离天星洲不远的海底。在东方云起掌舵混元宗的末期，异族曾经又一次来犯，在混元宗和东海龙族的合力回击之下，异族再次被重创。而东方宗主和混元宗三大部，还有九大堂的主力却在最后一战中被异族骗入了埋伏，全都牺牲了。其实混元宗在向宗主之后的时代就已经开始出现了分裂的迹象，但是因为历代宗主都不是善茬，所以下边的那些堂主还不敢太造次。但是东方宗主陨落的太突然，没有来得及指定接班人。而宗内原本最有机会成为下任宗主的战部大统领——翻天捣海镇万域——刘真君也随宗主一起道消了。几大之派的当家人也都一起陨落，剩下的中下层弟子互相都不服气彼此，因而最后也没能选出一个能让众人都敬服的掌门。拖了两年，混元宗的士气本来就已经十分低迷了，最后更是干脆分裂成十多个势力，各自**了。而此时原本直属于宗主的一小部分人不满这种情况，便拥立了一位东方宗主的弟子，在几位长老的操持下占据了混元宗本宗的地盘，仍以混元宗自居。但是后来没过多长时间，他们便被一伙不明身份势力所偷袭，新的第十代宗主赵器轩才只是个不到元神级别的修为，当场死于非命。最后只有一位长老拼死逃离，带走了混元宫和在混元宫内修炼的一小部分不入流的底层弟子侥幸逃出，他们不敢在天星洲居住，跨过了东海，回到了东天部洲。这些人后来组建了万化门，但是混元宗真正的传承几乎都断绝了。事后混元宗各大分支知道总门被灭，都十分的震怒，纷纷出手，几乎把天星洲翻了个底朝天。但是说到底分裂了的混元宗已经没有了从前底蕴，天星洲的其他势力也不再把他们放在眼里了。此事后来不了了之，也就成为了一段悬案。
混元宫因为元真子在大战时本体受损，没有随宗主出战，而是被东方宗主改变外形化作一枚玉简。交到一个留守内门的长老的手中，结果在总门大劫时那位长老后来因掩护他人而被击杀，被匆匆交托给另一位长老。自此以后没有人再会使用混元大道决，而混元子只能被迫休眠，再也无力帮助宗门弟子延续真正的传承了。混元宫被人当作是一块普通的玉简而在万化门的历代掌门手中流传，直到今天秦游重新祭炼混元宫才唤醒了元真子。
元真子的记忆受损，讲述的过程也是时有中断，费了很大的力气才把整个事情串连起来。说道最后，元真子情绪有点低落。秦游也叹了一口气，虽然元真子所讲和他以往听到的关于混元魔宗的传说不太相同，但是他直觉的相信，元真子所说的多半就应该是接近当年的真相了。他对元真子说：“小元子你也不必伤感了，现在既然本官机缘凑巧得到了混元魔宫，我定不使前人蒙羞，我先想办法帮你恢复全部法力。恰好我还认识那么几个万化门的弟子，他们走的还是混元宗的修行路子，将来，咱们帮他们重新回到正轨之上，也算对得起混元子前辈保护我们人族的恩情。”
之后秦游带着元真子一起来到了万里地方原，把乌明心等招拢过来，让元真子和他们见过。秦游对乌明心说：“小元子是混元魔宫的法傀，一切的机关总枢都可由他操控，我不在时，他代我掌控此处。你们在此修炼，小元子如有事差遣，你们要听他的安排。”
乌明心眨巴着眼睛看了看元真子，对秦游说：“公子，他凭什么管我们，难道我们还不如这个傀儡吗？”
秦游哈哈一笑，心道这个乌明心果然是刁钻，看来不让他吃点苦头他是很难对元真子服气。元真子恐怕不是普通傀儡那么简单，秦游总感觉他可能是和高破天一样，是法宝器灵一类的东西。如果真是那样的话，元真子就是能化身真形的强大存在，乌明心如何是他对手。秦游正好也想看看元真子的实力，就对元真子说：“小元子，这黑小子对你不服气，你去和他过过招吧。”
元真子对秦游一躬身说：“尊法旨。”便飞出八尺开外，在一处空地站下。乌明心生性好斗，一见此景，二话不说就电射而出，也不搭话动手就打。
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